8月14日,國家食品藥品監督管理總局醫療器械技術審評中心發布了《腫瘤相關突變基因檢測試劑(高通量測序法)性能評價通用技術審查指導原則》的征求意見稿。如有任何意見或建議,請于2018年9月15日前將反饋意見以電子郵件形式反饋審評中心。
腫瘤相關突變基因檢測試劑(高通量測序法)性能評價通用技術審查指導原則
適用范圍:本指導原則所述腫瘤相關基因檢測試劑分析性能評價主要是指基于高通量測序(high-throughput sequencing)即下一代測序(next generation sequencing, NGS),又稱為大規模平行測序(massively parallel sequencing, MPS),體外檢測人體組織中腫瘤細胞中腫瘤相關基因變異。用于檢測體細胞突變的NGS正在廣泛用于腫瘤診療相關的分子檢測,包括對特定基因的DNA/RNA進行測序,以尋找與腫瘤臨床診療相關的突變基因的改變。腫瘤基因突變類型包括點突變、插入、缺失、基因重排、拷貝數異常等廣義的基因突變。
基于NGS測序原理的IVD檢測可能包括以下步驟:樣本收集,處理和保存、DNA提取、DNA處理、文庫制備、測序和堿基識別、序列比對/映射、變異識別和過濾、變異注釋和解讀以及檢測報告的生成。同時,某些產品還可能會包括軟件部分,但上述相關步驟并不一定被全部包括,應根據產品的具體設計流程來進行判斷。對于每個檢測步驟,申請人需要結合產品設計和臨床意義來建立特定的可接受的質量評價指標和合格判斷標準。此外,為滿足產品特定預期用途,申請人需通過科學和適當的檢測性能研究來確定適用的試劑,消耗品,儀器和軟件。基于上述考慮因素,NGS檢測產品的設計和工作流程中的任何差異均可能導致結果的不同,因此申請人需要清楚地描述相關檢測性能指標。
分析性能評價的初衷在于提出產品性能有效性、安全性相關問題的假設,然后通過研究進行確認。NGS在測序通量及發現未知基因變異方面具有優勢,但是在NGS技術應用需求及使用中存在包括相關臨床樣本收集處理、NGS檢測內容、測序流程、數據分析、結果報告、技術質量認證和驗證等各方面的挑戰。
本指導原則將重點關注實體瘤中檢測具有臨床意義的體細胞變異和確保高質量的測序結果。申請人應以患者的利益為中心,充分整合臨床腫瘤學家對于精準診治的觀點,并充分考慮在我國推廣應用的可操作性。申請人可采用多樣化的靶向基因組合檢測。由靶向基因組產生的信息可能會被用于診斷分類,指導治療決策,和/或為特定腫瘤提供預后評價,不同產品包含的基因數量可能存在較大差異。
本指導原則適用于進行首次注冊申報和相關許可事項變更的產品。本指導原則不適用于基于胚系來源檢測,全外顯子檢測,腫瘤突變負荷(TMB)檢測,非靶向測序,從頭測序、微生物感染輔助診斷、游離DNA檢測、直接面向消費者測序、胎兒檢測、微生物基因組鑒定和藥物耐藥性檢測、胚胎植入前檢測、疾病風險(含遺傳風險) 評估與預測、RNA直接測序、篩查、獨立診斷目的、腫瘤基因組測序、健康個體測序檢測。